ImageJ – un software per analizzare ed elaborare i file di immagine. Il software è in grado di analizzare in modo efficace l’immagine e ricevere i dati tecnici dettagliati. ImageJ supporta la maggior parte dei formati di immagine e ha una serie di strumenti di editing. Il software consente di produrre le varie trasformazioni geometriche, creare gli istogrammi di densità, condurre una visualizzazione 3D, effettuare le operazioni logiche e aritmetiche tra le immagini, ecc ImageJ è in grado di lavorare contemporaneamente con più immagini, applicare i vari filtri e condurre l’elaborazione in batch di File. ImageJ contiene molti plagins che estendono notevolmente le capacità del software.